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La modélisation moléculaire implique l'utilisation des méthodes de calcul
de chimie computationnelle  (méthodes empiriques: mécanique moléculaire, dynamique moléculaire, QSAR, docking.....;  méthodes de mécaniques quantiques pures  : ab initio  et DFT ou semi-empirique (PM3, AM1, CNDO,..... permettant de déterminer la représentation graphique de la géométrie ou de la configuration des atomes d'une molécule et d'évaluer les propriétés physico-chimiques associés à la structure de la molécule étudiée. La modélisation moléculaire associée à une représentation infographique des stéréochimies permet d'interpréter des phénomènes physico-chimiques, de suggérer des nouvelles expériences et d'analyser
ainsi des résultats d'une façon plus critique que les expériences classiquement utilisées.
complémentaires.

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