Résumé de section

    • Objectifs du chapitre 

      1. Comprendre les bases de la bio-informatique.
      2. Analyser l'évolution des séquences et identifier les séquences homologues.
      3. Réaliser et évaluer des alignements de séquences.
      4. Mettre en œuvre l’algorithme de Needleman-Wunsch.
      5. Utiliser les modèles probabilistes pour l'analyse des séquences biologiques.
    • Contenu du chapitre Fichier

      Ce chapitre traite l’analyse des séquences biologiques. Il aborde les mutations, les alignements de séquences, les matrices de substitution et les algorithmes d’alignement. Il introduit également les modèles probabilistes utilisés pour identifier des régions fonctionnelles dans les génomes.

    • Références

      Vous pouvez consulter ces sources supplémentaires pour approfondir vos connaissances sur l'analyse et l'alignement des séquences biologiques:

      • Rosenberg, M. S. (Ed.). (2009). Sequence alignment: methods, models, concepts, and strategies. Univ of California Press.
      • Pearson, W. R. (2013). An introduction to sequence similarity (“homology”) searching. Current protocols in bioinformatics, 42(1), 3-1.
      • Replier Déplier

        Activités d'apprentissage

        • Travail Pratique sur l'analyse des séquences biologiques Devoir
          Ouvert le : vendredi 14 février 2025, 00:00
          À rendre : vendredi 21 février 2025, 00:00
          Les étudiants doivent
          Marquer comme terminé

          Nous allons utiliser dans ce TP les libraires “Biostrings” et “DECIPHER” pour aligner les séquences biologiques et analyser les motifs séquentiels. 

        • Test d'acquisition
          Les étudiants doivent
          Marquer comme terminé

          Ce test évalue votre compréhension et votre acquisition des connaissances du chapitre 4.

    • Forum de discussion pour chapitre 4