La chimie thérapeutique (également appelée pharmacochimie ou chimie médicinale) est une discipline scientifique qui consiste à concevoir, synthétiser et étudier des molécules biologiquement actives pour créer ou améliorer des médicaments.
Objectifs principaux
Relations Structure-Activité (RSA) : Comprendre comment la forme et la composition chimique d'une molécule influencent son effet thérapeutique et sa toxicité. 
Étude du métabolisme : Analyser le devenir du principe actif dans l'organisme (absorption, distribution, transformation et élimination — pharmacocinétique). 
Optimisation : Modifier une molécule tête de série pour améliorer son efficacité, réduire ses effets secondaires et optimiser sa biodisponibilité. 

La biopharmacie est une branche des sciences pharmaceutiques qui étudie comment la forme d'un médicament (comprimé, gélule, sirop,….) et sa composition influencent son absorption, sa diffusion et son efficacité dans le corps humain.

Ce cours d’initiation plonge les étudiants de deuxième année de Master en Chimie Pharmaceutique au cœur des outils numériques appliqués aux sciences du médicament. La maîtrise de ces logiciels constitue un levier stratégique majeur pour accélérer la découverte, le criblage virtuel, l’analyse physicochimique et l’assurance qualité pharmaceutique.

À travers des études de cas concrètes et des démonstrations méthodologiques, ce cours permet aux étudiants de développer une réelle maîtrise des outils de modélisation moléculaire 3D (Avogadro, PyMOL), de chimioinformatique et de docking (RDKit, AutoDock Vina), ainsi que du traitement de données spectrales, chromatographiques et d'analyse de données (OpenChrom, SpectraGraph, KNIME, Origin). L'enseignement met l'accent sur la rigueur des flux de travail, la traçabilité des données et l'aide à la décision, préparant directement les futurs spécialistes aux exigences numériques de la R&D, du contrôle qualité et de la pharmacochimie moderne.