Les micro-organismes sont abondants sur notre planète, même dans notre propre corps humain. Étonnamment, un humain adulte transporte environ 1,25 kg de micro-organisme. On les trouve partout, sur la peau, dans la bouche, le nez et dans toutes les parties de notre corps intérieur, en particulier dans le tractus gastro-intestinal. En dehors de l’être humain, des micro-organismes, notamment des virus, des bactéries, des champignons et des protozoaires, prolifèrent dans tous les environnements connus, des régions arctiques gelées aux tropiques chauds. 

On définit la microbiologie de l’environnement comme l'étude des micro-organismes dans tous les habitats terrestres et de leurs effets bénéfiques et néfastes sur la qualité de notre environnement et sur la santé et le bien-être humains, directement ou indirectement.

D’ailleurs, en interagissant entre eux et avec d'autres organismes, les micro-organismes sont également influencés par leur environnement immédiat, qu'il s'agisse du sol, de l'eau, de l'environnement marin profond ou d'un hôte végétal ou animal. Il est important de prendre en compte les environnements spécifiques dans lesquels les micro-organismes interagissent entre eux, avec d'autres organismes et avec l'environnement.

La microbiologie de l’environnement n'est pas seulement un domaine scientifique dynamique ; il est transformateur, en constante évolution à mesure que de nouveaux micro-organismes sont découverts et que de nouveaux aspects des activités microbiennes sont compris.

Le cours microbiologie de l’environnement, est une matière fondamentale, destiné aux étudiants de 3ème année Licence microbiologie. Cette formation permettra aux apprenants de se familiariser avec les différents micro-organismes de l’environnement ainsi :

·       De comprendre les interactions microbiennes des micro-organismes entre eux et avec leurs écosystèmes, représentés par les eaux, les sols, les végétaux ou le tube digestif de l’homme et de l’animal (savoir).

·       Dans ce cours, nous invitons les étudiants à distinguer entre l'impact bénéfique et néfaste des micro-organismes sur notre environnement (savoir-faire).

·       A la fin de ce cours, les étudiants acquerront des compétences qui leur permettent de maitriser utilisation des micro-organismes pour améliorer nos écosystèmes (savoir-être).

Techniques d’analyses biologiques