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Cours de Bioinformatique
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Espace de cours année 2020/2021 [Semestre 2]
Faculté des Sciences Exactes,des Sciences de la Nature et de la Vie
Département des Sciences de la Nature et de la Vie
Master 1
Biotechnologie Végétale
Cours de Bioinformatique
Chapitre 1: Initiation à la conception des bases de données (SGBDR)
Cours: Initiation à la conception des BD (ACCESS)
Cours: Initiation à la conception des BD (ACCESS)
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Chapitre 1 SGBDR.pdf
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Test de pré-requis
Cours: Banques de données biologiques
TP 01: Banques de données biologiques
Chapitre3: Alignement des séquences biologiques
TP04 Blast (logiciel de l'alignement)
Support pour le TP04 Blast
Cours 1: Motifs nucléiques
Cours 2: les motifs nucléiques et la matrice de poids
Cours 3: les motifs protéiques
Cours 1: Structures secondaires
Cours 2: Prédiction de structure secondaire (Algorithmes)
Cours: Initiation à la phylogénie moléculaire
TP 05: Annotation des gènes et conception des amorces
TP 03: Comment consulter et utiliser la Banque de structures PDB
Vidéo sur TP 05 (partie 1 de GENSCAN)
Vidéo sur le TP 05 (partie 2 Primer3)
Vidéo explicative sur l'alignement
Vidéo explicative sur l’alignement nucléique par les programmes dynamiques partie 1
Vidéo explicative sur l'alignement nucléique par les programmes dynamiques parties 2
(Vidéo) Alignement des séquences protéiques partie 1
Alignement des séquences protéiques partie 2
Test de sortie
Forum de discussion
Cours: Banques de données biologiques ►
Cours de Bioinformatique
Généralités
Chapitre 1: Initiation à la conception des bases de données (SGBDR)
Chapitre 2: Banques de données biologiques
Chapitre 3: Cours alignements des séquences nucléiques et protéiques
Chapitre 4: Motifs nucléiques
Chapitre 5: Prédiction de structure tridimensionnelle (secondaire) des protéines
Chapitre 6: Initiation à la phylogénie moléculaire.
TPs Bioinformatique
Vidéos explicatives
Test de sortie
Références bibliographiques
Section 11
Section 12
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