L'épidémiologie est l'étude de la distribution et des déterminants des maladies et des problèmes de santé dans les populations. Dans le cas des maladies infectieuses animales et végétales, on s'intéresse à comprendre comment ces maladies se propagent et affectent les animaux d'élevage, les animaux sauvages et les plantes cultivées.

Microbiologie de l'environnement se rapporte essentiellement aux processus microbiens globaux qui se déroulent dans le sol, l’eau ou les aliments ainsi que leurs impacts sur les plantes, et les effets à plus large échelle de la présence et des activités microbiennes.